De topónimo prerromano (quizá un antropónimo de origen vascón), su existencia no está atestiguada hasta el año 1030, cuando figura San Fructuoso de Senes como propiedad del monasterio de San Salvador de Puyó que Sancho III el Mayor donó al de San Juan de la Peña. Fue lugar de realengo casi sin interrupción hasta 1830 y entre 1215 y 1238 objeto del ataque de los nobles en rebelión contra Jaime I. Tiempo después su dominio recayó, por permuta con los reyes de Aragón, en Pedro Cornel (1276) y Rodrigo Jiménez de Luna (1289), aunque durante brevísimos periodos de tiempo, hasta que finalmente Jaime II lo recuperó en 1295.